Esto me paso varias veces y este sitio dejo de funcionar al investigar encontré esta solución. Todo lo que debes hacer es agregar 1 líneas de código en el archivo “wp-db.php” de WordPress.

Este se encuentra en la carpeta “wp-includes”, donde instalaste tu WordPress. Edita el archivo y busca el siguiente texto:
[php]
$this->ready = true;
[/php]

Agrega:
[php]
$this->query("set session wait_timeout=600");
[/php]
Bajo la linea indicada.